Ngay sau đó Trực đã bị Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an huyện Ngọc Hồi phát hiện và bắt giữ. Tại cơ quan Công an, Trực đã thành khẩn khai nhận về hành vi của mình; quá trình củng cố tài liệu chứng cứ xét thấy hành vi của Đặng Văn Trực có dấu hiệu phạm tội nên ngày 26 tháng 4 năm 2016 Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an huyện Ngọc Hồi đã ra Quyết định khởi tố vụ án, khởi tố bị can, tạm giam đối với Đặng Văn Trực để điều tra làm rõ.